Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actn1Q7TPR4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms