Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Shq1Q7TMX5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Shq1Q7TMX5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms