Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Uhrf2Q7TMI3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uhrf2Q7TMI3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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