Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dsg4Q7TMD7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg4Q7TMD7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg4Q7TMD7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg4Q7TMD7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg4Q7TMD7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg4Q7TMD7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg4Q7TMD7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg4Q7TMD7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dsg4Q7TMD7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms