Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SynmQ70IV5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms