Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SpopQ6ZWS8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms