Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf3Q6ZQA6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms