Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms