Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf1cQ6PDZ2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf1cQ6PDZ2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms