Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms