Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms