Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp49Q6P9L4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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