Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdac10Q6P3E7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms