Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl3Q6P1Y1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl3Q6P1Y1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms