Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig3Q6P1C6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms