Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Asic1Q6NXK8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms