Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc66Q6NS45 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc66Q6NS45 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms