Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CltbQ6IRU5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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