Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms