Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6DFW0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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