Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms