Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbno1Q689Z5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbno1Q689Z5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbno1Q689Z5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbno1Q689Z5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Sbno1Q689Z5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbno1Q689Z5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Sbno1Q689Z5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno1Q689Z5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno1Q689Z5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Sbno1Q689Z5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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Sbno1Q689Z5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Sbno1Q689Z5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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Sbno1Q689Z5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno1Q689Z5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno1Q689Z5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Sbno1Q689Z5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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Sbno1Q689Z5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Sbno1Q689Z5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Sbno1Q689Z5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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Sbno1Q689Z5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno1Q689Z5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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