Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms