Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja3Q64448 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja3Q64448 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms