Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tbr1Q64336 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tbr1Q64336 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tbr1Q64336 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tbr1Q64336 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tbr1Q64336 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tbr1Q64336 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tbr1Q64336 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tbr1Q64336 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Tbr1Q64336 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tbr1Q64336 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tbr1Q64336 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tbr1Q64336 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tbr1Q64336 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tbr1Q64336 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms