Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr2e1Q64104 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms