Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms