Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Zfp248Q640N4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Zfp248Q640N4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Zfp248Q640N4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Zfp248Q640N4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zfp248Q640N4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Zfp248Q640N4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Zfp248Q640N4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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