Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc18Q640L5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms