Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms