Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm5dQ62240 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kdm5dQ62240 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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