Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six2Q62232 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms