Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Six1Q62231 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Six1Q62231 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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