Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpaQ62189 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms