Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Aldh1a2Q62148 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Aldh1a2Q62148 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms