Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprrQ62132 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PtprrQ62132 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprrQ62132 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms