Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Npm1Q61937 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npm1Q61937 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms