Protein–RNA interactions for Protein: Q61817

Creb3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3Q61817 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Creb3Q61817 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms