Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smarcd1Q61466 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd1Q61466 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms