Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcolceQ61398 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PcolceQ61398 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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