Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxd4Q60688 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms