Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HnrnpdQ60668 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms