Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prdm1Q60636 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prdm1Q60636 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms