Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScinQ60604 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScinQ60604 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScinQ60604 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms