Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms