Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms