Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd40Q5SUE8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms