Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme4Q5SSW2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme4Q5SSW2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms