Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Utp18Q5SSI6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms