Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyfip2Q5SQX6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyfip2Q5SQX6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms